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Que fait COCOPAN ?
Le programme COCOPAN permet de réaliser une analyse de variance à un critère de classification pour des données quantitatives spatialement autocorrélées, lorsque le critère de classification consiste en une partition du territoire à l'étude en des sous-régions connexes -- par exemple des pays, des comtés, des groupes linguistiques, des subdivisions géomorphologiques, et ainsi de suite, comme on en rencontre dans nombre de problèmes dont les données peuvent être représentées sur une carte. La méthode a été décrite par Legendre, Oden, Sokal, Vaudor et Kim (1990) . L'acronyme COCOPAN vient du nom anglais de la méthode, Contiguity-constrained permutational ANOVA.
Le principe de ce test par permutations consiste à garder les localités immobiles, chacune conservant ses valeurs des différentes variables, de façon à préserver la structure d'autocorrélation. On permute plutôt le critère de classification, soit la division de la carte en sous-régions, avec les contraintes suivantes: chaque pseudo-région doit contenir le même nombre de localités que la région d'origine qu'elle représente; chaque pseudo-région doit demeurer connexe, i.e., former une surface continue sur la pseudo-carte; enfin, les pseudo-régions doivent occuper toute la carte d'origine, sans omission de localités ni dépassement. Le programme contient deux algorithmes permettant de résoudre ce problème informatique: l'algorithme des cercles concentriques, conçu par Alain Vaudor, et la méthode de l'arborescence aléatoire, développée par Junhyong Kim.
Plusieurs variables peuvent être analysées en une seule passe. La statistique utilisée dans le test permutationnel est la somme, pour tous les groupes, des sommes de carrés intragroupes (SCE). Après chaque permutation, on recalcule la statistique SCE pour cette pseudo-carte; on compare enfin la valeur SCE obtenue pour la vraie carte à la distribution des valeurs de SCE obtenues pour les pseudo-cartes. Le test est donc unilatéral et la région critique se trouve à l'extrémité gauche de la distribution.
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